尽管《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》从一个局部——主要是时值的组织形态方面——来考察节奏在音乐中的性状，但在撰写过程中笔者始终立足于这样一个基本的观点，即“由时值按照某种方式进行组织所构成的‘节奏’”仅仅是一种狭义的、字面的、概念化的节奏，而真实的、具有实践意义的节奏则具有更为广阔的含义，它存在于音乐的各个方面：乐句的、和声的、音色的、织体的等等。因此，节奏的研究应该以发展的眼光，在一种更加开阔的视野中来进行。所以，在《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》写作过程中，我常常会“分心”关照其他一些可能会产生某种节奏特征、并对音乐的运动产生影响的方面。其用意无非是以节奏为中心，力求找到更多观察和研究它的“点”，或者说尽可能去寻求从不同的方面研究节奏的可能性——有时是从研究方法的层面，有时是从分析方法的层间，有时是在视角方面。我认为，只有这样才能真正进入到节奏研究的内部，发现有价值的途径，获得有意义的成果。
作为一篇研究节奏形态及其功能方面的专著，我的主要目的，是在对以往的节奏研究成果进行观察和评价的基础上，通过对音乐节奏形态的研究来认识它在音乐运动中的作用。我认为，这种作用主要在于两个方面：一方面是它对于音乐结构力的作用，另一方面是它对于音乐的动力的作用。为达到这一目的，我尝试对那些容易使人产生多种解释(但不能说成是歧义)的节奏与节拍的概念进行讨论并对二者之间的关系进行一种梳理，然后在这样的基础上来提出自己的看法。就像在第二章中我所谈到的那样，我的一个重要观点就在于“在某一个特定层面上把节拍看成是节奏”，以便把节奏和节拍做关联性的研究。
基于内容的分类考虑，《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》共分为上、中、下三篇。
上篇由五章构成。这五章对节奏的概念、节奏研究的历史与现状、与节奏研究紧密关联的各个音乐要素、以及对节奏的形态研究方面起核心作用的某些方面等进行了论述。其中，作为本篇研究的重要结论，我提出了诸如“节奏结构是由多种要素来构成的”、“节奏与节拍具有同一性且在音乐中具有互动作用”、“重音是影响节奏结构最重要的因素”等观点。这些观点不仅强调了节奏或节拍的概念应该具有更加丰富的内涵，而且这两个概念还与其他的音乐要素具有更加广泛的联系。只有在这样的基础上去观察节奏结构，才能真正了解节奏在音乐运动的更深层次中到底产生了哪些作用。
以上篇中所讨论的内容为基础，我在中篇中侧重对使音乐趋向于稳定的一些节奏因素进行了讨论。其中的三章(第六、第七和第八章)对三个形成节奏稳定因素的、对节奏的运动具有结构力作用的层面进行了深入的讨论。第六章是在节奏构成的要素的层面——即长短关系、方正形态、疏密关系以及抑扬关系；第七章则是从节奏结构中节奏形态所显示出来的感知和组织特征方面；第八章从节奏在音乐整体运动中的不变性层面。这三个层面各自的作用以及它们协调的作用形成了音乐节奏运动内在的结构力。
下篇中的五章各自具有完全不同的作用。前面的三章(第九、第十和第十一章)主要承接中篇的内容，从动力的方面来考察不同的节奏形态在不同的音乐层面对于音乐运动和发展的推动作用。这几章中所涉及到的几个层面与中篇中的几章具有一定的对应关系：第九章侧重考察节奏结构中一些节奏形态的不协和性方面，它与第七章是直接相关的；第十章和第十一章对于节奏的暂态和节奏非一致性的考察与第八章也有紧密的关联。由此所获得的结论在于，节奏形态的不协和性、节奏在运动中的非定态结构以及非一致性作用形成了音乐内在运动的推动力。此后的第十二章也是我早期节奏研究成果的一个再现，是对20世纪中的某些节奏问题的一些考察，其中把节奏放在一个两极的框架中来讨论，这个两极的框架就是严格控制的序列化节奏和自由随机的节奏。对于《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》而言，这个章节具有一种补充的作用。因为对于节奏理论来说，20世纪中的许多节奏问题由于其多样性和作曲家的个性化原因，比之过去的节奏问题更加难以进行归纳和抽象，节奏体现了更多的风格化得特征。因此，《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》在这个章节中对20世纪音乐的节奏所进行的讨论也只是对一些作品中的节奏现象的观察，是一种提纲挈领式的，还远远没有深入下去。
最后的第十三章可以看成是《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》的结论部分，整个部分从六个方面对全文中所讨论的中心内容进行了归纳和抽象。应该说，这一章比较集中地反映了《音乐节奏结构的形态与功能:节奏结构力与动力若干问题的研究》形成的一个主要线索和基本思路。